24 DE JANEIRO DE 2022
GIORGIA GUGLIELMI
Infecções virais respiratórias e microbiota: uma revisão italiana faz um balanço da situação actual
Neste artigo
Infecções virais e microbiota
Microbiota respiratória e microbiota intestinal
DPOC, infecções e o microbioma
Microbiota intestinal e Covid-19
Estado da arte
Vários estudos mostram que a microbiota modula os desfechos das infecções, mas sua relação com a gravidade e progressão da doença ainda precisa ser esclarecida .
O que este estudo acrescenta
Os pesquisadores analisaram a literatura científica sobre microbiota respiratória e intestinal em pacientes com doenças respiratórias infecciosas e não infecciosas, incluindo COVID-19. Além disso, eles analisaram o papel de bactérias e vírus que residem no intestino humano e no tracto respiratório, bem como suas interacções e correlação com a gravidade da doença .
Conclusões
A análise do microbioma e do viroma pode favorecer o diagnóstico diferencial de patógenos e o desenvolvimento de intervenções direccionadas. Biomarcadores bacterianos de infecções respiratórias precisarão ser identificados .
Na literatura há cada vez mais evidências que sugerem como a microbiota humana é capaz de influenciar os resultados das infecções.
Recentemente, um grupo de pesquisadores revisou a literatura científica sobre as alterações na microbiota respiratória e intestinal que ocorrem em várias doenças respiratórias, incluindo a COVID-19 e publicou os resultados em uma revisão que apareceu nas páginas do Trends in Microbiology e coordenada por Andrea Iorio . Em particular, analisaram em humanos o papel de microrganismos bacterianos e virais presentes no intestino e tracto respiratório, bem como suas interacções e a ligação com a gravidade da doença.
A análise e o perfil de bactérias e vírus que residem no corpo humano podem, de fato, ajudar a diagnosticar diferentes patógenos (diagnóstico diferencial) e desenvolver novas intervenções direccionadas.
No entanto, biomarcadores bacterianos de infecções respiratórias precisarão ser identificados antes que a relação causal entre micróbios e doenças possa ser investigada.
Infecções virais e microbiota
Actualmente, sabe-se que 320 espécies virais classificadas em 26 famílias são capazes de infectar humanos. Alguns dos vírus mais abundantes são Anelloviridae, Bunyaviridae e Papillomaviridae , que representam mais de 40% de todos os vírus humanos.
As principais bactérias do tracto gastrointestinal humano incluem Firmicutes e Bacteroidetes , que representam 90% das bactérias intestinais.
A composição das comunidades de bactérias intestinais varia no mesmo indivíduo com base na idade, estilo de vida e outros factores.
As bactérias também residem na mucosa nasal, que é dominada por Propionibacterium, Staphylococcus, Bifidobacterium, Streptococcus e Moraxella , enquanto a microbiota oral contém principalmente Prevotella, Veillonella, Haemophilus, Fusobacterium e Neisseria .
Sabe-se que vírus e bactérias que residem no corpo humano interagem entre si e com o hospedeiro : por exemplo, a comunidade de vírus que vive no intestino molda o sistema imunológico gastrointestinal, regulando a inflamação intestinal.
No entanto, para comparar a microbiota de diferentes indivíduos em grandes estudos, os autores observam que "é importante entender as relações de causa e efeito entre a microbiota e a fisiopatologia das doenças, para identificar diferenças ou 'microbiomas centrais' conservados" de ecologia e funções bioquímicas em diferentes fases da vida e sob diferentes condições e avaliar correlações além da associação.
O perfil da microbiota também pode se tornar importante para revelar os diferentes mecanismos de infecções que fundamentam o início e a progressão de doenças , incluindo o COVID-19.
Microbiota respiratória e microbiota intestinal
A composição da microbiota respiratória tem sido estudada em várias doenças pulmonares crónicas, mas a relação entre o perfil da microbiota e a gravidade e progressão da doença ainda precisa ser elucidada.
O tracto respiratório superior, que inclui o nariz e a boca, é o principal ponto de entrada para patógenos .
A microbiota nasal de adultos saudáveis é dominada por seis tipos de bactérias, incluindo Staphylococcus, Moraxella e Haemophilus ; acredita-se que a alteração desta composição seja um biomarcador na rinossinusite crónica.
Da mesma forma, a asma grave parece estar relacionada a bactérias como Firmicutes e Actinobacteria, e uma alteração na composição microbiana caracterizada por altos níveis de proteobactérias tem sido associada ao aumento da inflamação e à doença mais grave.
Bebés com bronquiectasias do tracto respiratório inferior - uma condição de longo prazo causada pelo vírus sincicial respiratório - têm uma abundância aumentada de Haemophilus influenzae, Streptococcus, Corynebacterium, Moraxella e Staphylococcus aureus .
Alguns estudos também mostraram que infecções respiratórias podem alterar a microbiota intestinal : por exemplo, camundongos infectados com vírus sincicial respiratório ou vírus influenza tendem a ter níveis intestinais mais altos de Bacteroidetes e mais baixos que Firmicutes .
A microbiota pulmonar também pode ser afetada por infecções : bactérias específicas são comuns nas vias aéreas de pacientes com fibrose cística, fibrose pulmonar idiopática e bronquiectasias. Além disso, o perfil da microbiota intestinal de crianças com fibrose cística é caracterizado por altos níveis de Propionibacterium, Staphylococcus e Clostridiaceae e baixos níveis de Eggerthella, Eubacterium e Ruminococcus .
DPOC, infecções e o microbioma
Alguns estudos analisaram as comunidades de vírus que vivem nas vias aéreas de pessoas com doenças respiratórias.
Em adultos com doença pulmonar obstrutiva crónica (DPOC), os vírus prevalentes foram rinovírus, vírus influenza, coronavírus e vírus parainfluenza.
Em crianças com infecções respiratórias agudas recorrentes, um fago associado a propionibacterium foi particularmente abundante, enquanto em crianças com infecções respiratórias agudas graves, os pesquisadores detectaram principalmente vírus como Paramyxoviridae, Coronaviridae e Parvoviridae .
As interacções entre as comunidades de vírus e bactérias que vivem no trato respiratório podem influenciar o desenvolvimento e progressão de doenças respiratórias .
Isso acontece porque vírus como o vírus sincicial respiratório e o rinovírus podem promover a adesão de bactérias às células que revestem o trato respiratório , facilitando o crescimento e a persistência de patógenos como H. influenzae, Streptococcus pneumoniae e Pseudomonas aeruginosa .
A microbiota intestinal e a microbiota das vias aéreas também parecem estar interconectadas : mudanças na composição da comunidade de vírus no intestino de crianças com fibrose cística estão associadas a um aumento de fagos associados a proteobactérias e uma diminuição de fagos associados a Faecalibacterium prausnitzii .
Microbiota intestinal e Covid-19
Pesquisas recentes mostraram que a Prevotella é abundante em amostras fecais de pessoas com COVID-19, embora ainda não esteja claro se os níveis aumentados dessa bactéria precedem a infecção ou são consequência dela.
Níveis mais altos de Coprobacillus, Clostridium ramosum e Clostridium hathewayi foram associados a maior gravidade do COVID-19, enquanto níveis mais altos de F. prausnitzii foram associados à redução da gravidade da doença. Em comparação com pessoas saudáveis, os pacientes com COVID-19 também apresentam menor diversidade da microbiota intestinal e maior abundância de patógenos oportunistas , incluindo Rothia e Streptococcus , que em alguns casos têm sido associados a maior suscetibilidade a infecções pulmonares bacterianas secundárias.
Conclusões
“ Mais estudos sobre o microbioma humano nos ajudarão a entender os fenótipos da doença COVID-19 , confirmando a possibilidade de traduzir a microbiomica baseada em big data na prática diagnóstica e clínica”, concluem os pesquisadores.
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TAGS: COVID-19 , INFECÇÃO , MICROBIOTA INTESTINAL , MICROBIOTA PULMONAR
GIORGIA GUGLIELMI
Giorgia Guglielmi é uma escritora de ciência freelance baseada em Massachusetts, EUA. Ele é PhD em Biologia pelo Laboratório Europeu de Biologia Molecular e mestre em Escrita Científica pelo MIT.
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